المنهج الدراسي لمعهد الأخوة الإسلامي
المنهج الدراسي في العلوم الشرعية واللغة العربية مأخوذ من المملكة العربية السعودية، ولكن هذا المنهج الدراسي منتخب حتى يناسب الطلبة في أندونيسيا في أحوالهم وكفاءتهم العلمية. وأما المنهج الدراسي في العلوم العامة موافقة من قبل وزارة الشؤون التعليمية والتربوية بأندونيسيا
فتفصيل المنهج الدراسي لكل من المراحل الثلاث الإبتدائية والمتوسطة والثانوية كما يلي
المنهج الدراسي للمرحلة الإبتدائية
الأهداف الخاصة في مدرسة الإبتدائية: حفظ 15 جزءا من القرآن وحفظ الأحاديث الأربعين النوونية وفهم أسس العلوم الشرعية وفهم أسس اللغة العربية وفهم العلوم العامة
المنهج الدراسي للمرحلة المتوسطة
الأهداف الخاصة في مدرسة المتوسطة: حفظ 9 أجزاء من القرآن وحفظ الأحاديث المختارة وفهم العلوم الشرعية وفهم اللغة العربية وفهم العلوم العامة
المنهج الدراسي للمرحلة الثانوية
الأهداف الخاصة في المدرسة الثانوية: حفظ 6 أجزاء من القرآن والأحاديث المختارة وفهم العلوم الشرعية والعلوم الآلة واللغة العربية والعلوم العامة
